Seis meses se passaram desde que dois discípulos e um Cavaleiro da Integridade derrubaram a pontífice, Administrador. Com a luta finalizada, Alice começa a viver perto de sua cidade natal, o vilarejo Rulid. Ao lado dela está Kirito, que não apenas perdeu o seu braço e alma, mas também seu querido amigo Eugeo. Como Alice começou a se dedicar a cuidar do Kirito, ela também perdeu sua vontade de lutar que um dia já teve como um cavaleiro.
No entanto, o tempo para o teste final de estresse - que envolverá todo o Underworld em uma tragédia se aproxima implacavelmente.
Enquanto isso, nas áreas mais profundas do Dark Territory, o Deus das Trevas Vecta ressuscitou, como se esperasse por esse exato momento. Liderando um exército de forças das trevas, eles começam sua invasão ao império humano na esperança de conseguir a Sacerdotisa da Luz. A força do império humano liderada pelo Cavaleiro da Integridade Bercouli se prepara para uma guerra de escala inimaginável contra o exército do Dark Territory, mas mesmo assim, Alice não está em lugar algum, nem os dois heróis que salvaram o reino…